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重組克隆篩選
重組克隆篩選又稱為藍白斑篩選,是在指示培養(yǎng)基上用顏色直接篩選重組克隆的方法。迅數(shù)-全自動菌落分析儀的顏色識別功能模塊可以出色的區(qū)分出培養(yǎng)基圖象上的藍色/白色菌落,在一秒內(nèi)獲取培養(yǎng)基上藍色或者白色菌落數(shù)極其與菌落總數(shù)的比值。 藍白斑篩選是根據(jù)載體的遺傳特征篩選重組子,如α-互補、抗生素基因等。現(xiàn)在使用的許多載體都帶有一個大腸桿菌的DNA的短區(qū)段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的調(diào)控序列和前146個氨基酸的編碼信息。在這個編碼區(qū)中插入了一個多克隆位點(MCS),它并不破壞讀框,但可使少數(shù)幾個氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影響功能,這種載體適用于可編碼β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主細胞。因此,宿主和質(zhì)粒編碼的片段雖都沒有酶活性,但它們同時存在時,可形成具有酶學(xué)活性的蛋白質(zhì)。這樣,lacZ基因在缺少近操縱基因區(qū)段的宿主細胞與帶有完整近操縱基因區(qū)段的質(zhì)粒之間實現(xiàn)了互補,稱為α-互補。由α-互補而產(chǎn)生的LacZ+細菌在誘導(dǎo)劑IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在時產(chǎn)生藍色菌落,因而易于識別。然而,當(dāng)外源DNA插入到質(zhì)粒的多克隆位點后,幾乎不可避免地導(dǎo)致無α-互補能力的氨基端片段,使得帶有重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落。這種重組子的篩選,又稱為藍白斑篩選。如用藍白斑篩選則經(jīng)連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化的鈣化菌平板37℃溫箱倒置培養(yǎng)12-16hr后,有重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落。